答:DoTa/DoTr檢測是以檢測腫瘤異常激活癌蛋白及其構成的腫瘤檢查點,並精準匹配靶向藥物的全球專利技術,檢測包括三個步驟:
1、對腫瘤組織進行全轉錄組(RNA-seq)的高通量測序;
2、以美國VIPER專利技術,精準捕獲(定量)異常活性的癌蛋白及主調控蛋白(腫瘤檢查點);
3、按藥物的有效性,精準匹配靶向癌蛋白的藥物,並使腫瘤檢查點“塌陷”,從而實現從“(藥物)蛋白到(腫瘤)蛋白”的更直接、更精準的靶向治療。
該項技術已得到Nature、Cell、新英格蘭醫學雜誌等權威科學的發表及認可,發明人美國哥倫比亞大學Califano教授因此獲得“美國國家醫學科學院院士”。
答:目前,在腫瘤精準治療中僅有25%者可檢出可抑制突變,而其中又僅有50%對治療有反應。如(一)所述,DoTa/DoTr檢測無需檢測基因突變情況,而是通過檢測癌蛋白的異常活性及主調控蛋白(腫瘤檢查點),匹配可以抑制它們的靶向藥及化療藥物,首次實現從“(藥物)蛋白到(腫瘤)蛋白”的更直接、更精準的靶向治療,避免“盲目“試藥,爲臨牀無可抑制突變的患者提供了可靠的精準治療方案。
答:蛋白組學以“丰度”判斷蛋白質活性,有很大的侷限性和不足。蛋白質丰度只是細胞調節蛋白質活性的一種方式,蛋白質丰度可能與蛋白質活性有關,但只限於某些特定蛋白質和特定環境。蛋白質丰度體現的是蛋白質的數量,並非活性。
從生物學角度看,mRNA水平代表基因表達的中間狀態,能代表潛在的蛋白質表達情況。轉錄組測序能在較低能耗下實現較高的通量、分辨率和靈敏度,利用轉錄組數據建立蛋白搜索數據庫,將大大提升肽段及蛋白質的鑑定數量,平均可以增加蛋白鑑定數量20%-50%,這說明採用轉錄組比採用蛋白質組有可能獲得更多的信息。
DoTa/DoTr檢測通過RNA-Seq,獲得RNA的表達量,以VIPER專利技術推斷癌蛋白的活性是否異常(過度表達&被抑制),並找出腫瘤檢查點,匹配靶向它們的藥物。
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癌細胞生物學顯著特徵 | 蛋白纔是問題的核心 | 抗腫瘤藥物的作用機制 |
蛋白質活性異常導致癌細胞生成,全轉錄表達譜的改變可以更準確地反映這一異常狀況 | 腫瘤生物學特徵與藥物機制的直接對應 | 抗腫瘤藥並不進行基因編輯或基因修復,藥物的設計及作用點均圍繞蛋白質層面。 |
第一步:採集標本 | 第二步:測序 | 第三步:專利分析 | 第四步:藥物匹配 |
新鮮組織或蠟塊 新鮮組織用專用RNA保存液穩定 | 全轉錄組測序 NGS技術、Illumina平臺 | 專利技術(VIPER算法):精準捕獲癌蛋白及主調蛋白的活性水平並進行排序 | 將逆轉癌蛋白活性的藥物進行排序,精準匹配異常活性癌蛋白的靶向藥及化療藥物 |
答:以蛋白質爲核心的檢測靶標,無需檢測基因突變情況,是精準醫療新突破、實現癌細胞生物特徵與藥物機制的直接對應、比基因更深入,更全面、更精準,解決了大部分腫瘤,由於缺乏可抑制的突變(基因),而無法開展精準治療的難點。
(DoTa/DoTr檢測技術突破基因突變的範疇,不僅僅涵蓋了癌症來源的起始端--基因突變,更是將突變基因及其相互關聯,以及轉錄及翻譯的影響均納入其中,是對癌蛋白形成路徑全程監測,在癌症形成的最後步驟--蛋白質水平上進行監控檢測,通過檢測每個癌症患者個體差異的異常蛋白活性,特異性的匹配最適合癌症患者治療藥物,實現以癌蛋白爲靶點的更精準、更全面靶向治療。
DoTa/DoTr靶向藥範圍包括了靶向基因藥物在內的、對癌蛋白形成路徑能產生抑制的所有藥物,並將根據國內外的藥品審批情況將定期更新。目前,DoTa/DoTr檢測匹配藥物庫包含包括NMPA與FDA已批准的抗腫瘤藥物, 總計178種;可能在五年內批准或仍處於臨牀試驗階段的抗腫瘤藥物,總計近800種。)
基因檢測不覆蓋RNA及蛋白層面,缺少多基因之間關聯及轉錄與翻譯過程改變 |
基因檢測大多數突變位點,無法明確是不是和腫瘤有關 |
基因檢測大多數明確和腫瘤相關的基因突變,目前無上市的靶向藥 |
DoTa/DoTr 檢測 | 基因檢測 |
精準獲取6449個異常活性的癌蛋白活性報告; | 檢測200餘個驅動基因;
檢測80餘個可藥物抑制的基因; |
DoTa 檢測425個可藥物抑制的癌蛋白(主要是信號蛋白),DoTr檢測從2554個轉錄因子找出主調控蛋白; | 匹配近100種國內/外上市的靶向藥。 |
匹配180餘種國內上市的靶向藥及化療藥,其中包含所有國內上市的基因靶向藥。 |
答:在美國:DoTa/DoTr檢測項目獲得紐約衛生部批准,並取得CLIA認證實驗室授權,廣泛應用於臨牀,包括:哥倫比亞大學醫學中心等,CLIA認證代表了目前國際最高水平的認證標準,實驗室的LDTs項目可以在CLIA實驗室範圍內提供分子檢測業務以指導臨牀,而無需FDA批准。
在中國:DoTa/DoTr檢測項目中NGS技術的測序儀器,檢測試劑均已獲得藥監部門批准,並在國有控股廈門生物港臨牀醫學檢驗中心完成檢測,該中心已取得第三方醫學檢驗資質。
答:標本採集=>標本郵寄=>標本檢測=>報告郵寄=>報告解讀